RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 POLIQ9UNA4 740 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NOD1Q9Y239 953 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIP11Q15643 1979 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD13C9JR72 458 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ARVCFO00192 962 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 DNM1LO00429 736 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 TTC39CQ8N584 583 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.35■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PRLRP16471 622 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP5P24588 427 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 GNA15P30679 374 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.34■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP2Q9UGN5 583 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PADI3Q9ULW8 664 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF623O75123 536 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 WEE2P0C1S8 567 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.33■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 APOL6Q9BWW8 343 aa24.33■■□□□ 1.49
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CAPNS1-207ENST00000589146 MTA2O94776 668 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 RAB27AP51159 221 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 THAP2Q9H0W7 228 aa24.32■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 MYH10P35580 1976 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PIRO00625 290 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CALCAP01258 141 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP1A2P05177 515 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CKBP12277 381 aa24.31■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 CD52P31358 61 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPCQ03188 943 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 INCA1Q0VD86 236 aa24.31■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.31■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 ENC1O14682 589 aa24.3■■□□□ 1.48
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CAPNS1-207ENST00000589146 THAP12O43422 761 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CILPO75339 1184 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GHRP10912 638 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGA4P13612 1032 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 LRPAP1P30533 357 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-207ENST00000589146 WHAMMQ8TF30 809 aa24.3■■□□□ 1.48
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