RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.9□□□□□ -1.3
CLTC-211ENST00000579815 DNM3Q9UQ16 869 aa6.9□□□□□ -1.3
CLTC-211ENST00000579815 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.9□□□□□ -1.3
CLTC-211ENST00000579815 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.9□□□□□ -1.3
CLTC-211ENST00000579815 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.9□□□□□ -1.3
CLTC-211ENST00000579815 TMEM82A0PJX8 343 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RASSF10A6NK89 507 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CETN3O15182 167 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PJA2O43164 708 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PPIP5K2O43314 1243 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PRAMEF1O95521 474 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 C1QTNF9P0C862 333 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ACRP10323 421 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RAC2P15153 192 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 KIF11P52732 1056 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TCP10Q12799 353 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SLC15A2Q16348 729 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 WDR93Q6P2C0 686 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 C1QL4Q86Z23 238 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FAM151AQ8WW52 585 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 NKD1Q969G9 470 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SLC9A7Q96T83 725 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SPON2Q9BUD6 331 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 DEF6Q9H4E7 631 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 GINM1Q9NU53 330 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 KCND2Q9NZV8 630 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PNMA2Q9UL42 364 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TMX2Q9Y320 296 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.89□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 E9PMD0 336 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TRAF5O00463 557 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PDXKO00764 312 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 MAP2K7O14733 419 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PSPNO60542 156 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 MED24O75448 989 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 EYA4O95677 639 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TBC1D8O95759 1140 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 GH2P01242 217 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SERPING1P05155 500 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ZNF76P36508 570 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 EPS15P42566 896 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PPP2R5CQ13362 524 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 BBS9Q3SYG4 887 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.88□□□□□ -1.31
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CLTC-211ENST00000579815 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 FAM83AQ86UY5 434 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 LENG9Q96B70 501 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TCTN2Q96GX1 697 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 CCDC120Q96HB5 630 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 SLC38A3Q99624 504 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLTC-211ENST00000579815 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.88□□□□□ -1.31
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