RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 HECTD3Q5T447 861 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 VPS53Q5VIR6 699 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PCSK4Q6UW60 755 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KDELC1Q6UW63 502 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 LEKR1Q6ZMV7 388 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC103Q8IW40 242 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ULK2Q8IYT8 1036 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SPERTQ8NA61 448 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RCBTB1Q8NDN9 531 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 IL17REQ8NFR9 667 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF606Q8WXB4 792 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NRBF2Q96F24 287 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TNIP3Q96KP6 325 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1MQ96MI6 270 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 COG8Q96MW5 612 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TTPALQ9BTX7 342 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SARGQ9BW04 601 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CARD11Q9BXL7 1154 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MSL2Q9HCI7 577 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D22BQ9NU19 505 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM260Q9NX78 707 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OBP2AQ9NY56 170 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OGFRQ9NZT2 677 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PDP2Q9P2J9 529 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MTRRQ9UBK8 725 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OAZ3Q9UMX2 235 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PRELID1Q9Y255 219 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 JRKLQ9Y4A0 524 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CGNL1Q0VF96 1302 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KDRP35968 1356 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 KRIT1O00522 736 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 LTBRP36941 435 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 HSD17B2P37059 387 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 CYP4F3Q08477 520 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CLUL1Q15846 466 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 KRT71Q3SY84 523 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PDCL2Q8N4E4 241 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TTC39CQ8N584 583 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM58Q8NG06 486 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 STON2Q8WXE9 905 aa3.35□□□□□ -1.87
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