RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TCP11	Q8WWU5	503 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LAMA1	P25391	3075 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	EDIL3	O43854	480 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSPAN1	O60635	241 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DKK1	O94907	266 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	EPN2	O95208	641 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGHD	P01880	384 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RHO	P08100	348 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TUSC3	Q13454	348 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GAS6	Q14393	721 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP68	Q76N32	757 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	HES2	Q9Y543	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF197	O14709	1029 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC27A2	O14975	620 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTPN2	P17706	415 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMC3	P17980	439 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTEN	P60484	403 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARNTL	O00327	626 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADAMTS3	O15072	1205 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADAM12	O43184	909 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	AKAP3	O75969	853 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIF4A	O95239	1232 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEBPB	P17676	345 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYP3A7	P24462	503 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDC27	P30260	824 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR1D2	P34982	312 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GRM2	Q14416	872 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM143	Q96AN5	459 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CEP170P1	Q96L14	293 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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