RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568945.2

MKRN3-204, Transcript of makorin ring finger protein 3, human

TSL 4

Gene MKRN3, Length 2,740 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKRN3-204	ENST00000568945	KRT86	O43790	486 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CHRNB1	P11230	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ANXA8	P13928	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	AK2	P54819	239 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	HDX	Q7Z353	690 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	UCMA	Q8WVF2	138 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	DNAI1	Q9UI46	699 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	SBNO1	A3KN83	1393 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945		E9PCH4	1651 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TLR2	O60603	784 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	RARB	P10826	455 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KRT9	P35527	623 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	S100A12	P80511	92 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	FOXK2	Q01167	660 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	HERC3	Q15034	1050 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	HGH1	Q9BTY7	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	FLT1	P17948	1338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TP73	O15350	636 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	DMC1	Q14565	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KRT35	Q92764	455 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	LRGUK	Q96M69	825 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	EYA3	Q99504	573 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PDE7B	Q9NP56	450 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	STX8	Q9UNK0	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945		A6NHS1	94 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ST18	O60284	1047 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CLPTM1	O96005	669 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CACNB3	P54284	484 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CYP4F2	P78329	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CYP4F3	Q08477	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	PLD1	Q13393	1074 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.61	□□□□□ -0.71
MKRN3-204	ENST00000568945	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms