RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCTD16Q68DU8 428 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBL4BQ8N7F7 174 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 RUBCNQ92622 972 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAML3Q96JK9 1138 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SDCBP2Q9H190 292 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 GINS2Q9Y248 185 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BRB1 525 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 GJC1P36383 396 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASPAP45381 313 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSEN1P49768 467 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF132P52740 706 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCNA1P78396 465 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 DR1Q01658 176 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPRYD7Q5W111 196 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CST9Q5W186 159 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC31Q6UY01 552 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 IQCKQ8N0W5 287 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPTC7Q8NI37 304 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED4Q9NPJ6 270 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 USTQ9Y2C2 406 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.83□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIP11Q15643 1979 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM191BP0C7N4 346 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 STAG3L1P0CL83 205 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTGIRP43119 386 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAMLD1Q13495 774 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 JADE1Q6IE81 842 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SETD4Q9NVD3 440 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNX24Q9Y343 169 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM66O15016 1216 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC26A2P50443 739 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRPC3Q13507 836 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNX1Q13596 522 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TFDP1Q14186 410 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIC1Q14526 733 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF699Q32M78 642 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TWNKQ96RR1 684 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH3GL2Q99962 352 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 HEMGNQ9BXL5 484 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 VTA1Q9NP79 307 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSD3Q9NYI0 1048 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.82□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CTNNA2P26232 953 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSD17B3P37058 310 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 GRB14Q14449 540 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIZQ2M2Z5 673 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 JAMLQ86YT9 394 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 NLRP7Q8WX94 980 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TINF2Q9BSI4 451 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 KAT6AQ92794 2004 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSF2BPO75031 334 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITGB3P05106 788 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 MMP3P08254 477 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 BPIFB4P59827 614 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 OGDHQ02218 1023 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACVR2BQ13705 512 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms