RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFHBQ8N7U6 833 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 BORCS6Q96GS4 357 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 SENP8Q96LD8 212 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF560Q96MR9 790 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLXNA3P51805 1871 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM49P0CI25 452 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM49CP0CI26 452 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 BFSP1Q12934 665 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM15Q13444 863 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR65Q8IYL9 337 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-208ENST00000566515 KPNA7A9QM74 516 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLP2RO95838 553 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNPLA4P41247 253 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 BIRC3Q13489 604 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL19A1Q14993 1142 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SV2CQ496J9 727 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 APPL2Q8NEU8 664 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 HLA-CQ95604 372 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED15Q96RN5 788 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FNIP2Q9P278 1114 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM12O43184 909 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCK2O43639 380 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHACTR2O75167 634 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAX3P23760 479 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDXDC1Q6P996 788 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP37Q86T82 979 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 HPDLQ96IR7 371 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP63Q96MT8 703 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYB561D2O14569 222 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 IKBKBO14920 756 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC34A2O95436 690 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADH1AP07327 375 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 LTBRP36941 435 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDUFV1P49821 464 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 AP3M2P53677 418 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CREMQ03060 361 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP3CAQ08209 521 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNC3Q14003 757 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PALB2Q86YC2 1186 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTRRQ9UBK8 725 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSC2P49815 1807 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX10O75333 385 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ODC1P11926 461 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPCAMP16422 314 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCLMP48507 274 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLCN4P51793 760 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO1EQ12965 1108 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPC3Q13507 836 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SV2AQ7L0J3 742 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 VNN1O95497 513 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTMSP20962 102 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNA5P22460 613 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL6P60660 151 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFF2Q03403 129 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZACNQ401N2 412 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 DACH1Q9UI36 760 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 FSD2A1L4K1 749 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 H7C4K7 107 aa22.53■■□□□ 1.2
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