RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 H7C4K7 107 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ZMYND10O75800 440 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ZNF280DQ6N043 979 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 RDH13Q8NBN7 331 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CXorf38Q8TB03 319 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SENP8Q96LD8 212 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.62■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 TCHHQ07283 1943 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 WDR27A2RRH5 827 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 OAZ2O95190 189 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 C8AP07357 584 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ARPP19P56211 112 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PNOCQ13519 176 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 RNF135Q8IUD6 432 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 BORCS6Q96GS4 357 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ITGB3P05106 788 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 TAF6P49848 677 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 KCNB1Q14721 858 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 LIN9Q5TKA1 542 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 INTS13Q9NVM9 706 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PLXNA3P51805 1871 aa20.6■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ABLIM3O94929 683 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ODC1P11926 461 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 TYMPP19971 482 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PAX3P23760 479 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CYP24A1Q07973 514 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 DMAC2Q9NW81 257 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SIX4Q9UIU6 781 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.59■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 EXOC3O60645 756 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CYP11A1P05108 521 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 OR4Q2P0C623 313 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PSMD6Q15008 389 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 SURF1Q15526 300 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 USP37Q86T82 979 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 NR2E1Q9Y466 385 aa20.58■□□□□ 0.89
EDC3-211ENST00000566243 KPNA7A9QM74 516 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 PDXKO00764 312 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 CYB561D2O14569 222 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 CCL16O15467 120 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 SEC24AO95486 1093 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 ATF2P15336 505 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 HOXA9P31269 272 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 UVSSAQ2YD98 709 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 SV2CQ496J9 727 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 WDR49Q8IV35 697 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 ZNF560Q96MR9 790 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 TIGD1Q96MW7 591 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 PIDD1Q9HB75 910 aa20.57■□□□□ 0.88
EDC3-211ENST00000566243 CLUHO75153 1309 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms