RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ARL2	P36404	184 aa		19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM143	Q96AN5	459 aa		19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		19.54	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRJ	Q12913	1337 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ATG7	O95352	703 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRA	P18433	802 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	GLRA2	P23416	452 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	RXRB	P28702	533 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R40	P59535	323 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	SNCB	Q16143	134 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD6	Q53TS8	623 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	PASD1	Q8IV76	773 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	FAM84A	Q96KN4	292 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	RLF	Q13129	1914 aa		19.53	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NDC80	O14777	642 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2C2	O75185	946 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	EGFR	P00533	1210 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD2	P08910	425 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ICAM3	P32942	547 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	RFC5	P40937	340 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	WNT7B	P56706	349 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	MCL1	Q07820	350 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NCOA4	Q13772	614 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP2	Q15833	593 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC38	Q5VT99	294 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	VSTM1	Q6UX27	236 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	PIM2	Q9P1W9	311 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	HACL1	Q9UJ83	578 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	SUN1	O94901	812 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TJP3	O95049	919 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	CALB1	P05937	261 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	VPS41	P49754	854 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	HMGCS2	P54868	508 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	UST	Q9Y2C2	406 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		19.52	■□□□□ 0.72
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	BRAF	P15056	766 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MMP8	P22894	467 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	KLRC2	P26717	231 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	COPS2	P61201	443 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	DNER	Q8NFT8	737 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FAM212A	Q96EL1	285 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO40	Q9UH90	709 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CFH	P08603	1231 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CD58	P19256	250 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ATP4A	P20648	1035 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF132	P52740	706 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NR1H3	Q13133	447 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	GRM1	Q13255	1194 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MGARP	Q8TDB4	240 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	TTC25	Q96NG3	672 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	WRNIP1	Q96S55	665 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	MTFR1L	Q9H019	292 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		19.51	■□□□□ 0.71
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		19.5	■□□□□ 0.71

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