RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559885.1

GATM-210, Transcript of glycine amidinotransferase, humanhuman

TSL 2

Gene GATM, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATM-210ENST00000559885 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FBXL18Q96ME1 805 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CEP63Q96MT8 703 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 GUCD1Q96NT3 240 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 IGFLR1Q9H665 355 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 INTS13Q9NVM9 706 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ANO10Q9NW15 660 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 COG5Q9UP83 839 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TRANK1O15050 2925 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PTPRSQ13332 1948 aa9.5□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 EPOPA6NHQ4 379 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 C2CD2LO14523 706 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 IKBKBO14920 756 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FAM189A1O60320 539 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 KIF4AO95239 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NFICP08651 508 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 VAMP7P51809 220 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NLRP12P59046 1061 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 DSG1Q02413 1049 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ZBTB6Q15916 424 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 HASPINQ8TF76 798 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 HLA-CQ95604 372 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 KCNK17Q96T54 332 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CGRRF1Q99675 332 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 IRAK3Q9Y616 596 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.49□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ITGB3P05106 788 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 LINC00271P0C7V0 271 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ATICP31939 592 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ELF1P32519 619 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 GTF2H1P32780 548 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NRIP1P48552 1158 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NDUFV1P49821 464 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ERVFC1P60507 584 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TNNC1P63316 161 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TPM4P67936 248 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 BFSP1Q12934 665 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ADGRE1Q14246 886 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 NAB2Q15742 525 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PSMD5Q16401 504 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 STX1AQ16623 288 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 WDR44Q5JSH3 913 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ZNF280DQ6N043 979 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 GPT2Q8TD30 523 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 RABGGTAQ92696 567 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CASP10Q92851 521 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 SUSD3Q96L08 255 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 ZBP1Q9H171 429 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 DMAC2Q9NW81 257 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CLDND1Q9NY35 253 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FNIP2Q9P278 1114 aa9.48□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 KPNA7A9QM74 516 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PIRO00625 290 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 CYB561D2O14569 222 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 FSCN2O14926 492 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 GLUD1P00367 558 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 C1RP00736 705 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TYMPP19971 482 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 LILRA4P59901 499 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 MYL7Q01449 175 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 TSPY1Q01534 308 aa9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GATM-210ENST00000559885 PTPN14Q15678 1187 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms