RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 RTKNQ9BST9 563 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MTRRQ9UBK8 725 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CCDC39Q9UFE4 941 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 POLIQ9UNA4 740 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 USP24Q9UPU5 2620 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CLDN3O15551 220 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TRAPPC3O43617 180 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TRAK2O60296 914 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ADRB2P07550 413 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CLTAP09496 248 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ADCY1Q08828 1119 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SLC10A6Q3KNW5 377 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TSSK4Q6SA08 328 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DNASE1L2Q92874 299 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HEBP1Q9NRV9 189 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TBX20Q9UMR3 447 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 COL4A2P08572 1712 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FAM189A1O60320 539 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 B3GAT3O94766 335 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FAM13AO94988 1023 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 RHOP08100 348 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TXLNAP40222 546 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CLCNKBP51801 687 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MTAPQ13126 283 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZBTB6Q15916 424 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GLRA4Q5JXX5 417 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MYCT1Q8N699 235 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 LINC00301Q8NCQ3 95 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CLIC6Q96NY7 704 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 IER2Q9BTL4 223 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 STRA6Q9BX79 667 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HAPLN2Q9GZV7 340 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SEL1LQ9UBV2 794 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CDY1Q9Y6F8 540 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 A0A0B4J269 797 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TTC26A0AVF1 554 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MAN2B1O00754 1011 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PPP6R2O75170 966 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PPP1R37O75864 691 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MICAL2O94851 1124 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ADRB1P08588 477 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FCARP24071 287 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 NRLP54845 237 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 OSTNP61366 133 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 RRAGBQ5VZM2 374 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ING5Q8WYH8 240 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HVCN1Q96D96 273 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DNAJC19Q96DA6 116 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MCRS1Q96EZ8 462 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CHRDQ9H2X0 955 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 STYXL1Q9Y6J8 313 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DCDC2BA2VCK2 349 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 K7ENM7 598 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SYN3O14994 580 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 OGTO15294 1046 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 LRP3O75074 770 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ABLIM3O94929 683 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 YEATS4O95619 227 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 KRT18P05783 430 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GAP43P17677 238 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PTPN2P17706 415 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CYP3A5P20815 502 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 LIG4P49917 911 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SLC39A4Q6P5W5 647 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SV2BQ7L1I2 683 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms