RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544823.5

QKI-215, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 2

Gene QKI, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-215	ENST00000544823	KCNA2	P16389	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	GRIA3	P42263	894 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ZNF81	P51508	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62	8e-8	■■■■■ 37.6
QKI-215	ENST00000544823	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823		A0A1W2PS29	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MPPED1	O15442	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PROP1	O75360	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SRGN	P10124	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MC2R	Q01718	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SNX19	Q92543	992 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PPP3CB	P16298	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	HSD3B2	P26439	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	2e-7	■■■■■ 29.8
QKI-215	ENST00000544823	ERVK-21	P61565	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	NDUFS2	O75306	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SUN1	O94901	812 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CD1A	P06126	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ITGB6	P18564	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	IL10RA	Q13651	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	MT-CO1	P00395	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	NR2F6	P10588	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	DPF1	Q92782	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KAT5	Q92993	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TIMP4	Q99727	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823		F5H697	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CLSTN1	O94985	981 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	RHO	P08100	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	PTPRR	Q15256	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	JADE3	Q92613	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QKI-215	ENST00000544823	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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