RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZEB2O60315 1214 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FGFR4P22455 802 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 AP3M2P53677 418 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF410Q86VK4 478 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT81Q8WYA0 676 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP350Q5VT06 3117 aa21.65■■□□□ 1.06
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PACSIN3-211ENST00000539589 FGGP02679 453 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM192Q8IY95 271 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP85Q9BW27 656 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIP11Q15643 1979 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPAN1O60635 241 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PHACTR2O75167 634 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL2Q13617 745 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS18Q9P253 973 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NFU1Q9UMS0 254 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ESYT3A0FGR9 886 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 KPNA6O60684 536 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXD10P28358 340 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MESDQ14696 234 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB9Q96C00 473 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SCLT1Q96NL6 688 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 HMGCRP04035 888 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGA4P13612 1032 aa21.63■■□□□ 1.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 OSTNP61366 133 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R5EQ16537 467 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 C7orf31Q8N865 590 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GINS2Q9Y248 185 aa21.63■■□□□ 1.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 CITO14578 2027 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NCOA4Q13772 614 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR49Q8IV35 697 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG3Q92685 438 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 OSMRQ99650 979 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CLTAP09496 248 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GGCXP38435 758 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL1Q13616 776 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SURF1Q15526 300 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 WHAMMQ8TF30 809 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM11Q96F44 468 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SPC25Q9HBM1 224 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CLSTN1O94985 981 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ALS2CLQ60I27 953 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 RAET1EQ8TD07 263 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GUA9 196 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ASGR1P07306 291 aa21.6■■□□□ 1.05
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