RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259		R4GN57	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CIT	O14578	2027 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	XYLB	O75191	536 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ABLIM3	O94929	683 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PLS3	P13797	630 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GAP43	P17677	238 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GRM5	P41594	1212 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NPTX2	P47972	431 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMTN	P53814	917 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FOXK2	Q01167	660 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DPYD	Q12882	1025 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MAPK7	Q13164	816 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDT1	Q9H211	546 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	POLI	Q9UNA4	740 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC16A4	O15374	487 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KCNE1	P15382	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RFX1	P22670	979 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PROZ	P22891	400 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SHD	Q96IW2	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UROC1	Q96N76	676 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BIN1	O00499	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KLRC4	O43908	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RHO	P08100	348 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CD72	P21854	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ID4	P47928	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OSTN	P61366	133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ROR1	Q01973	937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PSMD2	Q13200	908 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FZD5	Q13467	585 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GDE1	Q9NZC3	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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