RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528704.1

ATG13-212, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 5

Gene ATG13, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-212ENST00000528704 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CLDN3O15551 220 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ADCY3O60266 1144 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ZNF862O60290 1169 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TOM1L1O75674 476 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PROSCO94903 275 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 HLA-DRAP01903 254 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 KRT14P02533 472 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ADRB2P07550 413 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MMEP08473 750 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ITGA4P13612 1032 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 LSP1P33241 339 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PIK3CAP42336 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PLTPP55058 493 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 POU5F1BQ06416 359 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MCL1Q07820 350 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 NR1H3Q13133 447 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CUL2Q13617 745 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 KRT71Q3SY84 523 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MTERF2Q49AM1 385 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TTMPQ5BVD1 217 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 LBX2Q6XYB7 198 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 WDR49Q8IV35 697 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CCDC89Q8N998 374 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 EXD1Q8NHP7 514 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SEMA4DQ92854 862 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ART4Q93070 314 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ARL8AQ96BM9 186 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SAAL1Q96ER3 474 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CENPHQ9H3R5 247 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 RIPK3Q9Y572 518 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 NFS1Q9Y697 457 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 UNCXA6NJT0 531 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 NFKBIEO00221 500 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TJP3O95049 919 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 IL18RAPO95256 599 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PAEPP09466 180 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 P4HA1P13674 534 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 DESP17661 470 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 OSBPP22059 807 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ECHS1P30084 290 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 GNA15P30679 374 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PTGIRP43119 386 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SNX16P57768 344 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CDC42EP1Q00587 391 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TNFAIP2Q03169 654 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ZNF844Q08AG5 666 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 TRPC3Q13507 836 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ACAP1Q15027 740 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CCNG2Q16589 344 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PTGISQ16647 500 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 MAPK6Q16659 721 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 SGO2Q562F6 1265 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 WDR78Q5VTH9 848 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 METTL7BQ6UX53 244 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ZNF365Q70YC5 407 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PCGF5Q86SE9 256 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 PRELID2Q8N945 189 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
ATG13-212ENST00000528704 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms