RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 KXD1Q9BQD3 176 aa20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 STK17AQ9UEE5 414 aa20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 A0A087X0B3 334 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 MYMKA6NI61 221 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 PRRG1O14668 218 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 MOSPD3O75425 235 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 FCARP24071 287 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 JADE1Q6IE81 842 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 USP28Q96RU2 1077 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 CEP72Q9P209 647 aa20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 OBSL1O75147 1896 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 SPTLC1O15269 473 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 GFRA3O60609 400 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 LRG1P02750 347 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 GLULP15104 373 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ADSSP30520 456 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ELF1P32519 619 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 EPHA5P54756 1037 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 STARD6P59095 220 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ADCY1Q08828 1119 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ASCL5Q7RTU5 278 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 FOXQ1Q9C009 403 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 GDE1Q9NZC3 331 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 CEP250Q9BV73 2442 aa20.46■□□□□ 0.87
CTTN-211ENST00000527622 ANO9A1A5B4 782 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OR4Q2P0C623 313 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PTPN2P17706 415 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TYMPP19971 482 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ACOT2P49753 483 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 LILRA4P59901 499 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 KCNA1Q09470 495 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ANGPT1Q15389 498 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DYMQ7RTS9 669 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CD302Q8IX05 232 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PJA1Q8NG27 643 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CORO1BQ9BR76 489 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MAFFQ9ULX9 164 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 YIPF1Q9Y548 306 aa20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PRR23AA6NEV1 266 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SHISA7A6NL88 538 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 PIRO00625 290 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ECI2O75521 394 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CPB1P15086 417 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ABCD1P33897 745 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TWF1Q12792 350 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 HVCN1Q96D96 273 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 LRRC3Q9BY71 257 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DERAQ9Y315 318 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 C2CD2Q9Y426 696 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 NCANO14594 1321 aa20.44■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 LRRN2O75325 713 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MICAL2O94851 1124 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CASP5P51878 434 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 WNT7BP56706 349 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SLC39A14Q15043 492 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ADALQ6DHV7 355 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SENP8Q96LD8 212 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 TMEM209Q96SK2 561 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 ASB7Q9H672 318 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 CACNA1AO00555 2505 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 OR6C75A6NL08 312 aa20.42■□□□□ 0.86
CTTN-211ENST00000527622 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms