RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 RIPK3Q9Y572 518 aa10.72□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 CES2O00748 559 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ASIC1P78348 528 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 MAN2A1Q16706 1144 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SLFN12Q8IYM2 578 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.71□□□□□ -0.698e-7■□□□□ 10.2
TRPS1-211ENST00000520276 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 IQCDQ96DY2 449 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 HIC2Q96JB3 615 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 HAPLN3Q96S86 360 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 FAM192AQ9GZU8 254 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 WBP1LQ9NX94 342 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 TBX10O75333 385 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ELNP15502 786 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 TNFAIP2Q03169 654 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 RNF43Q68DV7 783 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ARMCX2Q7L311 632 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 SPOCK2Q92563 424 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 ERP44Q9BS26 406 aa10.71□□□□□ -0.69
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GUL6 1792 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 HMGCRP04035 888 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LYNP07948 512 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MYL3P08590 195 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ERFP50548 548 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DR1Q01658 176 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35B4Q969S0 331 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DYDC2Q96IM9 177 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM9Q9C026 710 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 STOML1Q9UBI4 398 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.71□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CAPN9O14815 690 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 FAM160B1Q5W0V3 765 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PEX26Q7Z412 305 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 RNF180Q86T96 592 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MIPEPQ99797 713 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ATP2A1O14983 1001 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 FOXN2P32314 431 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TRAPPC10P48553 1259 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CBX3Q13185 183 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CEP55Q53EZ4 464 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF365Q70YC5 407 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TAOK1Q7L7X3 1001 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEB3O15480 346 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT3HO75486 399 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 BCRP11274 1271 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF24P17028 368 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PLCG1P19174 1290 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 OCRLQ01968 901 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LIN52Q52LA3 116 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GRHL1Q9NZI5 618 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 NUMBLQ9Y6R0 609 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK2Q92608 1830 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 RIPK2O43353 540 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 STAM2O75886 525 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PTK2Q05397 1052 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 GNASQ5JWF2 1037 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 KRT82Q9NSB4 513 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 PDP2Q9P2J9 529 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM221A6NGB7 291 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms