RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519823.2

MTCL1-208, Transcript of microtubule crosslinking factor 1, human

TSL 4

Gene MTCL1, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTCL1-208	ENST00000519823	NCAM2	O15394	837 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MOSPD3	O75425	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MYH11	P35749	1972 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PRPH	P41219	470 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ME1	P48163	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	EPHA5	P54756	1037 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CEP72	Q9P209	647 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	LAD1	O00515	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TDGF1	P13385	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CDC25A	P30304	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PTPA	Q15257	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	HYI	Q5T013	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	KCNN1	Q92952	543 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823		A0A1W2PQ27	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823		A0A1W2PQ64	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823		A0A1W2PQD8	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823		M0QZQ0	153 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SLC16A4	O15374	487 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TOM1L1	O75674	476 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	OAZ2	O95190	189 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TGM1	P22735	817 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ARPP19	P56211	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MTAP	Q13126	283 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	DDX12P	Q92771	950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CUTA	O60888	179 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	VNN2	O95498	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PSMC3	P17980	439 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	LRPAP1	P30533	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	MCL1	Q07820	350 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	GRM2	Q14416	872 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	IRF7	Q92985	503 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MTCL1-208	ENST00000519823	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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