RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC78A2IDD5 438 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 SOCS2O14508 198 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRIAP1O43715 76 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 FKBP9O95302 570 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ASMTLO95671 621 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 LATS1O95835 1130 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 EBLN1P0CF75 366 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 NR2F6P10588 404 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ALDH9A1P49189 494 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 BMPR2Q13873 1038 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 TCEA2Q15560 299 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 FKBP9P1Q75LS8 142 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 LRRTM3Q86VH5 581 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 AUTS2Q8WXX7 1259 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ORAI2Q96SN7 254 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRSS22Q9GZN4 317 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 EHD3Q9NZN3 535 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 LRP12Q9Y561 859 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 LCHNA4D1U4 455 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMIM22K7EJ46 135 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 QSOX1O00391 747 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 GPR32O75388 356 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 HAUS5O94927 633 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 NXPH3O95157 252 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ELFN1P0C7U0 828 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 GUCY1A2P33402 732 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 TWIST1Q15672 202 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANO4Q32M45 955 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-561P-201ENST00000516222 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 CCHCR1Q8TD31 782 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-561P-201ENST00000516222 GALNT16Q8N428 558 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-561P-201ENST00000516222 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-561P-201ENST00000516222 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.21□□□□□ -2.06
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