RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KYAT1Q16773 422 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 RAD54LQ92698 747 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ASB16Q96NS5 453 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.4■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
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HERC3-211ENST00000513325 PIGRP01833 764 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 GJA1P17302 382 aa18.39■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 USP37Q86T82 979 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 BEST2Q8NFU1 509 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 FAM212AQ96EL1 285 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 BRD9Q9H8M2 597 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.39■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 DMDP11532 3685 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 A0A0B4J269 797 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 PPEF2O14830 753 aa18.38■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 VNN2O95498 520 aa18.38■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 EPHA5P54756 1037 aa18.38■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 BRAPQ7Z569 592 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 LEMD2Q8NC56 503 aa18.38■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 NELL2Q99435 816 aa18.38■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 ASAH2Q9NR71 780 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 YIPF1Q9Y548 306 aa18.38■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 SHISA7A6NL88 538 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 TBCAO75347 108 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 GTF2BQ00403 316 aa18.37■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 GPR17Q13304 367 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 TEAD2Q15562 447 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 JADE1Q6IE81 842 aa18.37■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.37■□□□□ 0.53
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HERC3-211ENST00000513325 OR6C75A6NL08 312 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 NCAM2O15394 837 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 NFICP08651 508 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 PSMC3P17980 439 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 TYMPP19971 482 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 GDI1P31150 447 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 DDIT3P35638 169 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 VIPR2P41587 438 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA9P43362 315 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 LILRA4P59901 499 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 OVOS1Q6IE37 1185 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 VITQ6UXI7 678 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CD302Q8IX05 232 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CLDN23Q96B33 292 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 TISP43B9A030 160 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 SPTLC1O15269 473 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ID4P47928 161 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ACOT2P49753 483 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 PLD1Q13393 1074 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 FZD5Q13467 585 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 CENPPQ6IPU0 288 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 USP49Q70CQ1 688 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 IRF7Q92985 503 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 EPSTI1Q96J88 318 aa18.35■□□□□ 0.53
HERC3-211ENST00000513325 SENP8Q96LD8 212 aa18.35■□□□□ 0.53
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