RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CEP135	Q66GS9	1140 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	LILRA6	Q6PI73	481 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SENP8	Q96LD8	212 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	FNBP1	Q96RU3	617 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CGRRF1	Q99675	332 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	S1PR5	Q9H228	398 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PAX3	P23760	479 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TAF6	P49848	677 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ADAM9	Q13443	819 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	APPL2	Q8NEU8	664 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TGM5	O43548	720 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	AKAP3	O75969	853 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	C1R	P00736	705 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TNNC2	P02585	160 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SPATA31D3	P0C874	917 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TNNI1	P19237	187 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	OR1D2	P34982	312 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	GPT2	Q8TD30	523 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TSC2	P49815	1807 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	MBTPS2	O43462	519 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	GLUD1	P00367	558 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	KRT19	P08727	400 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	CLDN10	P78369	228 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	RBP5	P82980	135 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	RAB33A	Q14088	237 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	APOL5	Q9BWW9	433 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TTC3-223	ENST00000492275	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	KPNA7	A9QM74	516 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275		H7C4K7	107 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	MAPK13	O15264	365 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	OAZ2	O95190	189 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TYMP	P19971	482 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DLG4	P78352	724 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF560	Q96MR9	790 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CYB561D2	O14569	222 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	IL9	P15248	144 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CCNE1	P24864	410 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PNPLA4	P41247	253 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	SV2C	Q496J9	727 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TMC2	Q8TDI7	906 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PSMA7	O14818	248 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CYP11A1	P05108	521 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ODC1	P11926	461 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R2	P41236	205 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	STIM1	Q13586	685 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	TSG101	Q99816	390 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	CETN3	O15182	167 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC63	Q05C16	580 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	BFSP1	Q12934	665 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TTC3-223	ENST00000492275	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04

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