RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 EPHB4P54760 987 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GRM7Q14831 915 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 METTL24Q5JXM2 366 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ANKS6Q68DC2 871 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 FITM2Q8N6M3 262 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SCAMP4Q969E2 229 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1191Q96A73 305 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 CRB3Q9BUF7 120 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 USP40Q9NVE5 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 MYO1CO00159 1063 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A4P31645 630 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK10P53779 464 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP8Q13202 625 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PRR16Q569H4 304 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SLFN13Q68D06 897 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 BEND5Q7L4P6 421 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 XYLT1Q86Y38 959 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1EQ8WY54 764 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 IQCDQ96DY2 449 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PPC4 97 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF785A8K8V0 405 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 LAMTOR5O43504 91 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CTBP1Q13363 440 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA2Q92186 375 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MAML1Q92585 1016 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SPON1Q9HCB6 807 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS3O15072 1205 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 THAP12O43422 761 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TYRP1P17643 537 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HALP42357 657 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 PMS2P11Q13670 270 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 USP37Q86T82 979 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 SNX22Q96L94 193 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G3Q9NZ20 509 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 AGFG2O95081 481 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 UNC5CO95185 931 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM14Q14142 442 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MICU3Q86XE3 530 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 POGKQ9P215 609 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CDC23Q9UJX2 597 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TMX2Q9Y320 296 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WWL8 130 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 CDHR4A6H8M9 788 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB5O75953 348 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND5P03915 603 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 GRPP07492 148 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 FGFR2P21802 821 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 KLRC1P26715 233 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ICA1Q05084 483 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 STARD3Q14849 445 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 FANCBQ8NB91 859 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF566Q969W8 418 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRC-212ENST00000491302 TOX2Q96NM4 488 aa9.24□□□□□ -0.93
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