RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	FSIP1	Q8NA03	581 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GDE1	Q9NZC3	331 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		18.74	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087X0B3	334 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GVL5	298 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO9	A1A5B4	782 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SRF	P11831	508 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	IDE	P14735	1019 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PFKFB1	P16118	471 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN2	P17706	415 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	DSE	Q9UL01	958 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PIEZO1	Q92508	2521 aa		18.73	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR27	A2RRH5	827 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424		I3L4J1	428 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PIR	O00625	290 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF197	O14709	1029 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LRG1	P02750	347 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP11A1	P05108	521 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SLFN14	P0C7P3	912 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRA4	P59901	499 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR4	Q13639	388 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	E2F4	Q16254	413 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		18.72	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CIT	O14578	2027 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRG1	O14668	218 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	MYB	P10242	640 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	ADSS	P30520	456 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR17	Q13304	367 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	JADE1	Q6IE81	842 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	USP37	Q86T82	979 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	PANK4	Q9NVE7	773 aa		18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA8	A3KMH1	1905 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL16	O15467	120 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL1	P05976	194 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ODC1	P11926	461 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PNPLA4	P41247	253 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ASIC1	P78348	528 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NHLH1	Q02575	133 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PLD1	Q13393	1074 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ELMOD1	Q8N336	334 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF13	Q92913	245 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	HPSE	Q9Y251	543 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		18.7	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GCNT3	O95395	438 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	AFM	P43652	599 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT2	P49753	483 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFA8	P51970	172 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA5	P54756	1037 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	IER5L	Q5T953	404 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA18	Q8TC71	538 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM9	Q9C026	710 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB3	Q9Y575	518 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		18.69	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF202	O95125	648 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	RHO	P08100	348 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	AOC1	P19801	751 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SURF1	Q15526	300 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCE	Q6IPM2	695 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		18.68	■□□□□ 0.58
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58

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