RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CST5P28325 142 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF132P52740 706 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GPC5P78333 572 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM270Q6UE05 265 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SIX4Q9UIU6 781 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DERAQ9Y315 318 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ANK1P16157 1881 aa11.1□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 M0QZ92 97 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT19P08727 400 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GNA15P30679 374 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ATICP31939 592 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ASPAP45381 313 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS6KA1Q15418 735 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PEX26Q7Z412 305 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RSPH3Q86UC2 560 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 COG1Q8WTW3 980 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 DPF3Q92784 378 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF653Q96CK0 615 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM11Q96F44 468 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 SNX27Q96L92 541 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.09□□□□□ -0.63
GTPBP1-211ENST00000487538 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF185O15231 689 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 THAP12O43422 761 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MTA2O94776 668 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF4AO95239 1232 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CALCAP01258 141 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGB3P05106 788 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP1A2P05177 515 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 P4HA1P13674 534 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RBP5P82980 135 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC181Q5TID7 509 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 DAAM2Q86T65 1068 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SESTD1Q86VW0 696 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CREG2Q8IUH2 290 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CXorf38Q8TB03 319 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF12Q96FN5 646 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MMS19Q96T76 1030 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 BCO2Q9BYV7 579 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CISHQ9NSE2 258 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 DPP3Q9NY33 737 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SNTG2Q9NY99 539 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF14Q9UBS8 474 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 POLIQ9UNA4 740 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.08□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 DNM1LO00429 736 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CES2O00748 559 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ASGR1P07306 291 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MYBL1P10243 752 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CD58P19256 250 aa11.07□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PAFAH1B1P43034 410 aa11.07□□□□□ -0.64
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