RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 CXorf38Q8TB03 319 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 BORCS6Q96GS4 357 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 SENP8Q96LD8 212 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 DMAC2Q9NW81 257 aa22.65■■□□□ 1.22
ACTB-211ENST00000480301 PDXKO00764 312 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 OAZ2O95190 189 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MTHFRP42898 656 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SURF1Q15526 300 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 POMKQ9H5K3 350 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 INTS13Q9NVM9 706 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PTPRJQ12913 1337 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND10O75800 440 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TYMPP19971 482 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TAF6P49848 677 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ROR1Q01973 937 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF280DQ6N043 979 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SPATA20Q8TB22 786 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 EXOC3O60645 756 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ABLIM3O94929 683 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 KIF20AO95235 890 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ITGB3P05106 788 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CYP24A1Q07973 514 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PSMD6Q15008 389 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SIX4Q9UIU6 781 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SCN1AP35498 2009 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 WDR27A2RRH5 827 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 WDR49Q8IV35 697 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 GSDMAQ96QA5 445 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MUC3AQ02505 3323 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 KPNA7A9QM74 516 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CYB561D2O14569 222 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 NR3C1P04150 777 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CYP11A1P05108 521 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 C8AP07357 584 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ODC1P11926 461 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA4P41247 253 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ARPP19P56211 112 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 RBP5P82980 135 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 UVSSAQ2YD98 709 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SV2CQ496J9 727 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 USP37Q86T82 979 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 ZNF560Q96MR9 790 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 RMND1Q9NWS8 449 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 KINO60870 393 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SMC2O95347 1197 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 MYBPC2Q14324 1141 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 LIN9Q5TKA1 542 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 SMARCE1Q969G3 411 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-211ENST00000480301 FNBP1Q96RU3 617 aa22.59■■□□□ 1.21
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