RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	TRANK1	O15050	2925 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PSMA7	O14818	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CXCL14	O95715	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	GLP2R	O95838	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MBD3	O95983	291 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ITGB3	P05106	788 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CCNE1	P24864	410 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DLG4	P78352	724 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DSG1	Q02413	1049 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	NFIL3	Q16649	462 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DUSP6	Q16828	381 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TSG101	Q99816	390 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	SIX4	Q9UIU6	781 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PIR	O00625	290 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ADAM12	O43184	909 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	LILRB3	O75022	631 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TBX10	O75333	385 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	KRT19	P08727	400 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TNNI1	P19237	187 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	FGFR3	P22607	806 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	BFSP1	Q12934	665 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PAK1	Q13153	545 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ADAM9	Q13443	819 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	STIM1	Q13586	685 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	SURF1	Q15526	300 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	USP41	Q3LFD5	358 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TTI2	Q6NXR4	508 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	SUSD3	Q96L08	255 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MED15	Q96RN5	788 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TLE6	Q9H808	572 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CHST7	Q9NS84	486 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		10	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TEX28	O15482	410 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TNNC2	P02585	160 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	EPCAM	P16422	314 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TAF6	P49848	677 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	NLRP12	P59046	1061 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	LILRA4	P59901	499 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	TFF2	Q03403	129 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	LRRC63	Q05C16	580 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	PSMD5	Q16401	504 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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