RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 CDH7Q9ULB5 785 aa14.13□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 H7C4K7 107 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PRRG1O14668 218 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 XYLBO75191 536 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GCNT3O95395 438 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 RHOP08100 348 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ATF2P15336 505 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CASP1P29466 404 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 LILRA4P59901 499 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ADCY1Q08828 1119 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 E2F4Q16254 413 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 KYAT1Q16773 422 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GPR152Q8TDT2 470 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CA14Q9ULX7 337 aa14.12□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ANO9A1A5B4 782 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 H0Y858 1186 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PIRO00625 290 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PPP6R2O75170 966 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 OAZ2O95190 189 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GAP43P17677 238 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SCP2P22307 547 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ELF1P32519 619 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 HOXD13P35453 343 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CCR2P41597 374 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GPC5P78333 572 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 APPL2Q8NEU8 664 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 BEST2Q8NFU1 509 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DHX58Q96C10 678 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SENP8Q96LD8 212 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ACCSQ96QU6 501 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 KXD1Q9BQD3 176 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CORO1BQ9BR76 489 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 KCNH6Q9H252 994 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CEP72Q9P209 647 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 LRG1P02750 347 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CPB1P15086 417 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 GJA1P17302 382 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CEBPBP17676 345 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PTPN2P17706 415 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ZNF280DQ6N043 979 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DPP3Q9NY33 737 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CUTAO60888 179 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SOAT2O75908 522 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 POU2F2P09086 479 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SRFP11831 508 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 MRE11P49959 708 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 TWF1Q12792 350 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 DUSP4Q13115 394 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 TPGS2Q68CL5 300 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 CD302Q8IX05 232 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.09□□□□□ -0.15
HPS1-211ENST00000478087 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms