RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476541.1

CIZ1-217, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CIZ1, Length 513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1-217ENST00000476541 SUSD3Q96L08 255 aa20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 FAM81BQ96LP2 452 aa20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 VPS16Q9H269 839 aa20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.22■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 H3BNC9 293 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 M0QZQ0 153 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 CLSTN1O94985 981 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 FAM163BP0C2L3 166 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 ODC1P11926 461 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 PBX3P40426 434 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 MYL6P60660 151 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 TNNC1P63316 161 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 GPR153Q6NV75 609 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 DPH6Q7L8W6 267 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 APPL2Q8NEU8 664 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.21■□□□□ 0.83
CIZ1-217ENST00000476541 ARHGEF15O94989 841 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 EFEMP2O95967 443 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SOD2P04179 222 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TYMPP19971 482 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 USP41Q3LFD5 358 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 FAM84AQ96KN4 292 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ZNF576Q9H609 170 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 GCNT4Q9P109 453 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TSC2P49815 1807 aa20.2■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 PPEF2O14830 753 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 CBFA2T2O43439 604 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 HUS1O60921 280 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ITGB1P05556 798 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 FANCCQ00597 558 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 CREMQ03060 361 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 GPM6BQ13491 265 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 UVSSAQ2YD98 709 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 METTL23Q86XA0 190 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TTC39CQ8N584 583 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 HASPINQ8TF76 798 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 RABGGTAQ92696 567 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SENP8Q96LD8 212 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 NT5C1BQ96P26 610 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.19■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 A0A1B0GTH6 734 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 CYB561D2O14569 222 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 CYP11A1P05108 521 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 FGFR3P22607 806 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 RFX1P22670 979 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 BRCC3P46736 316 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 UBXN1Q04323 297 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TTPALQ9BTX7 342 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 RBSNQ9H1K0 784 aa20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 F8W810 466 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SPTLC1O15269 473 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 URODP06132 367 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 GLUD2P49448 558 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 UBASH3AP57075 661 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 PTPROQ16827 1216 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SARM1Q6SZW1 724 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 VPS52Q8N1B4 723 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 SEMA4DQ92854 862 aa20.17■□□□□ 0.82
CIZ1-217ENST00000476541 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms