RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	USP25	Q9UHP3	1055 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	C2CD2	Q9Y426	696 aa		16.02	■□□□□ 0.16
SSR4-208	ENST00000471880	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	LRG1	P02750	347 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ASGR2	P07307	311 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	NTHL1	P78549	312 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	METTL23	Q86XA0	190 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SENP8	Q96LD8	212 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		16.01	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	UBE4B	O95155	1302 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	WDR27	A2RRH5	827 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF233	A6NK53	670 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ITGB3	P05106	788 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ADRB2	P07550	413 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	OR4Q2	P0C623	313 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	COL9A1	P20849	921 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	TAF6	P49848	677 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CDR1	P51861	262 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	WNT7B	P56706	349 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	LILRA4	P59901	499 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	BFSP1	Q12934	665 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PTPN21	Q16825	1174 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	FAM84A	Q96KN4	292 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF560	Q96MR9	790 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	TSC2	P49815	1807 aa		16	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880		M0QZQ0	153 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CYB561D2	O14569	222 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SPTLC1	O15269	473 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	C1R	P00736	705 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PRR29	P0C7W0	189 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	FSHR	P23945	695 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	HOXD13	P35453	343 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ADCY1	Q08828	1119 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SV2C	Q496J9	727 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	FNBP1	Q96RU3	617 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	HPSE	Q9Y251	543 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	UST	Q9Y2C2	406 aa		15.99	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQ27	194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQ64	194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQD8	194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	PIR	O00625	290 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	GPR37L1	O60883	481 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	TNNC2	P02585	160 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	TNNI1	P19237	187 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZXDA	P98168	799 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	MTMR3	Q13615	1198 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	UVSSA	Q2YD98	709 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ELMOD1	Q8N336	334 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	EDA	Q92838	391 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		15.98	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	ANO9	A1A5B4	782 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C75	A6NL08	312 aa		15.97	■□□□□ 0.15
SSR4-208	ENST00000471880	TGFB1I1	O43294	461 aa		15.97	■□□□□ 0.15

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