RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 PBX2P40425 430 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 ASPAP45381 313 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 BRCC3P46736 316 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 LRMPQ12912 555 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 TIGD5Q53EQ6 642 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 UBR7Q8N806 425 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 UROC1Q96N76 676 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 ARID3AQ99856 593 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 NME7Q9Y5B8 376 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.97■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 LINC01553A4QN01 128 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 I3L4J1 428 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 TLL1O43897 1013 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 OR1G1P47890 313 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 TRPC3Q13507 836 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF699Q32M78 642 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 IQCEQ6IPM2 695 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 HASPINQ8TF76 798 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 TAF4BQ92750 862 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 BCO2Q9BYV7 579 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR88Q9GZN0 384 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.96■□□□□ 0.15
SLC13A3-209ENST00000468915 KPNA7A9QM74 516 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 B3GAT3O94766 335 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 UCHL3P15374 230 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 TAF6P49848 677 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 RRAGAQ7L523 313 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 TDHQ8IZJ6 230 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.96■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 M0QZQ0 153 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 GYPCP04921 128 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ALDH2P05091 517 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CDH8P55286 799 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 GCNT1Q02742 428 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CETN1Q12798 172 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FIGNQ5HY92 759 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FIBCD1Q8N539 461 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 BAP1Q92560 729 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 IGSF21Q96ID5 467 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SUSD3Q96L08 255 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SENP8Q96LD8 212 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF560Q96MR9 790 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 NT5C1BQ96P26 610 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 PBX4Q9BYU1 374 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 L1RE1Q9UN81 338 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.95■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CDC25BP30305 580 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 PNPLA4P41247 253 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 RAP1GAPP47736 663 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 JAM2P57087 298 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CUL2Q13617 745 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.94■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CA3P07451 260 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 WEE2P0C1S8 567 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 LAG3P18627 525 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 TAP1Q03518 808 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO1EQ12965 1108 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 SV2CQ496J9 727 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 OSTM1Q86WC4 334 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 WHAMMQ8TF30 809 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF558Q96NG5 402 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SLC13A3-209ENST00000468915 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms