RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.64■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 OR4Q2P0C623 313 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 IDEP14735 1019 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 CEBPBP17676 345 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TWF1Q12792 350 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SPATA1Q5VX52 437 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 IQCEQ6IPM2 695 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DTWD2Q8NBA8 298 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ANK1P16157 1881 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SLC39A14Q15043 492 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 STK38Q15208 465 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 GFRA3O60609 400 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 OAZ2O95190 189 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 GCNT3O95395 438 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ADRB2P07550 413 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ODC1P11926 461 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 GAP43P17677 238 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PDILTQ8N807 584 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 HVCN1Q96D96 273 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 GDE1Q9NZC3 331 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ZNF197O14709 1029 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 LILRA4P59901 499 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ANGPT1Q15389 498 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 HS6ST3Q8IZP7 471 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SENP8Q96LD8 212 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ASB7Q9H672 318 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DERAQ9Y315 318 aa23.6■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 A0A087X0B3 334 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 OR6C75A6NL08 312 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 MYL4P12829 197 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 KCNA1Q09470 495 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SHDQ96IW2 340 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ACCSQ96QU6 501 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 FOXQ1Q9C009 403 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ASAH2Q9NR71 780 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 CEP72Q9P209 647 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 MAFFQ9ULX9 164 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 YIPF1Q9Y548 306 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SPTLC1O15269 473 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PPP1R37O75864 691 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TYMPP19971 482 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 CCR2P41597 374 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 PFKPQ01813 784 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DUSP4Q13115 394 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 POSTNQ15063 836 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 DPP3Q9NY33 737 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 C2CD2Q9Y426 696 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 SCN1AP35498 2009 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 TCHHQ07283 1943 aa23.58■■□□□ 1.37
TTC28-204ENST00000468807 ECI2O75521 394 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 GJA1P17302 382 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 ADSSP30520 456 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 CASP5P51878 434 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 TANGO2Q6ICL3 276 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 SAAL1Q96ER3 474 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 PANK4Q9NVE7 773 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.57■■□□□ 1.36
TTC28-204ENST00000468807 PIRO00625 290 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms