RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ERVFC1P60507 584 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MYL6P60660 151 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MYL7Q01449 175 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 UBE3AQ05086 875 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 KCNH2Q12809 1159 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MYO1EQ12965 1108 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CAMK1Q14012 370 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 USP41Q3LFD5 358 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZACNQ401N2 412 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TMC7Q7Z402 723 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 LUZP1Q86V48 1076 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TCF25Q9BQ70 676 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZBP1Q9H171 429 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 LZTS1Q9Y250 596 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CYB561D2O14569 222 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 LRRN2O75325 713 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CXCL14O95715 111 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CAVIN2O95810 425 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 EFEMP2O95967 443 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 URODP06132 367 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ODC1P11926 461 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ATP1A3P13637 1013 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 GLUD2P49448 558 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF445P59923 1031 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ADGRE1Q14246 886 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 IQCB1Q15051 598 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MAN2A1Q16706 1144 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PTPROQ16827 1216 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF699Q32M78 642 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 RTP2Q5QGT7 225 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MYLIPQ8WY64 445 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SEMA4DQ92854 862 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SUSD3Q96L08 255 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SENP8Q96LD8 212 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TTPALQ9BTX7 342 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 STK39Q9UEW8 545 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.5□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 HIDE1A8MVS5 230 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 M0QZQ0 153 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CTSAP10619 480 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF18P17022 549 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 FGFR3P22607 806 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ATICP31939 592 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 TNNC1P63316 161 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 DSG1Q02413 1049 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 KRT31Q15323 416 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PTPN14Q15678 1187 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 VWA3BQ502W6 1294 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MIIPQ5JXC2 388 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 RNF214Q8ND24 703 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 APPL2Q8NEU8 664 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 GUCD1Q96NT3 240 aa9.49□□□□□ -0.89
CASQ1-202ENST00000467691 MMS19Q96T76 1030 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms