RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ARL2P36404 184 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PRKCEQ02156 737 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 NOGQ13253 232 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CUL2Q13617 745 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ITIH4Q14624 930 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 IER5Q5VY09 327 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SPRYD7Q5W111 196 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PALB2Q86YC2 1186 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TTC39CQ8N584 583 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ATG4CQ96DT6 458 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SCLT1Q96NL6 688 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CGRRF1Q99675 332 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZNF302Q9NR11 478 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SNX24Q9Y343 169 aa9.06□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 A0A0B4J269 797 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 H0YHG0 523 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 IRF6O14896 467 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZNF862O60290 1169 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DRAP01903 254 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 GSTA1P08263 222 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PYGBP11216 843 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CETPP11597 493 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PTPN7P35236 360 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PIK3CAP42336 1068 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SLC26A2P50443 739 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SLC29A2Q14542 456 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 STAT4Q14765 748 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 EMC2Q15006 297 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 KYAT1Q16773 422 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ZNF365Q70YC5 407 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PCGF5Q86SE9 256 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 WDR49Q8IV35 697 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 RAPGEF5Q92565 580 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 KRT35Q92764 455 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 GLG1Q92896 1179 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TATDN2Q93075 761 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 C18orf8Q96DM3 657 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 SAAL1Q96ER3 474 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CAPNS2Q96L46 248 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TTC25Q96NG3 672 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 PNMA3Q9UL41 463 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 NR2E1Q9Y466 385 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CEP83Q9Y592 693 aa9.05□□□□□ -0.96
ACTB-208ENST00000464611 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.04□□□□□ -0.96
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