RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 JAG2Q9Y219 1238 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 K7ESM1 405 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D4O60343 1298 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RECQL4O94761 1208 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA31D3P0C874 917 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TM4SF4P48230 202 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PIGFQ07326 219 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CRHR2Q13324 411 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ICAM4Q14773 271 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 DPP9Q86TI2 863 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 GJA10Q969M2 543 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PGBD4Q96DM1 585 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LOXL4Q96JB6 756 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CD248Q9HCU0 757 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 USP19O94966 1318 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF785A8K8V0 405 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TBX3O15119 743 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM24O15164 1050 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A2P23975 617 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 FMO1Q01740 532 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NHLH2Q02577 135 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PLP2Q04941 152 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC39A13Q96H72 371 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ADOQ96SZ5 270 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PNKPQ96T60 521 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 APOL5Q9BWW9 433 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 XDHP47989 1333 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3CBP42338 1070 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PHKA1P46020 1223 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 HTR3AP46098 478 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB32Q13637 225 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MORC3Q14149 939 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LONRF1Q17RB8 773 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZRM9 215 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 USP37Q86T82 979 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SYT12Q8IV01 421 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PMM1Q92871 262 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MED15Q96RN5 788 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SRRDQ9UH36 339 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PADI4Q9UM07 663 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO1CO00159 1063 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 BTN3A1O00481 513 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ABHD16AO95870 558 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL3P08590 195 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ACRV1P26436 265 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SCNN1GP51170 649 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 BTKQ06187 659 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF844Q08AG5 666 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TCF15Q12870 199 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LONRF3Q496Y0 759 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TMIEQ8NEW7 156 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC138Q96M89 665 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.84□□□□□ -1.31
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