RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 RDH13Q8NBN7 331 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PRRG1O14668 218 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ADAM12O43184 909 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KLRC4O43908 158 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 TNNC2P02585 160 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 C8AP07357 584 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ALADP13716 330 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 HOXD13P35453 343 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 LILRA4P59901 499 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SV2CQ496J9 727 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 LILRA6Q6PI73 481 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 FNBP1Q96RU3 617 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 M0QZQ0 153 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PPEF2O14830 753 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC3O60645 756 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 XYLBO75191 536 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ZMYND10O75800 440 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PRR29P0C7W0 189 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PNPLA4P41247 253 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 STK4Q13043 487 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RNF135Q8IUD6 432 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SENP8Q96LD8 212 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DSEQ9UL01 958 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 TSC2P49815 1807 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MYO10Q9HD67 2058 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.14■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PIRO00625 290 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 TGFB1I1O43294 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CLSTN1O94985 981 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ITGB3P05106 788 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ROR1Q01973 937 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.13■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ANO9A1A5B4 782 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CYB561D2O14569 222 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CCL16O15467 120 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DCXO43602 365 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 LRG1P02750 347 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 TNNI1P19237 187 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 TYMPP19971 482 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DPYDQ12882 1025 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 BFSP1Q12934 665 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 UVSSAQ2YD98 709 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RMND1Q9NWS8 449 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.12■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CLUHO75153 1309 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 SMC2O95347 1197 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RBP5P82980 135 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MYO1EQ12965 1108 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.11■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 WDR27A2RRH5 827 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 OR6C75A6NL08 312 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 KPNA7A9QM74 516 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 KINO60870 393 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 RHOBTB3O94955 611 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 WNT7BP56706 349 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 PNOCQ13519 176 aa22.1■■□□□ 1.13
SCAF8-204ENST00000461219 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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