RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPN4-208ENST00000460289 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPN4-208ENST00000460289 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPN4-208ENST00000460289 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
PTPN4-208ENST00000460289 MAFFQ9ULX9 164 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPN4-208ENST00000460289 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 WDR27A2RRH5 827 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TYMPP19971 482 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CASP1P29466 404 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PAGE5Q96GU1 130 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 POLIQ9UNA4 740 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HPSEQ9Y251 543 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 UBE4BO95155 1302 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 C2orf16Q68DN1 1984 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PPEF2O14830 753 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CCL16O15467 120 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 MYL1P05976 194 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ODC1P11926 461 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TCEAL8Q8IYN2 117 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SENP8Q96LD8 212 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 DENND4AQ7Z401 1863 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PRRG1O14668 218 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 FSHRP23945 695 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HOXD13P35453 343 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TAF6P49848 677 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 NUCB2P80303 420 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CYP4F11Q9HBI6 524 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PQ27 194 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PQ64 194 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PQD8 194 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM221A6NGB7 291 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF233A6NK53 670 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 OR6C75A6NL08 312 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 M0R296 226 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 LRG1P02750 347 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ASGR2P07307 311 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CPB1P15086 417 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SYKP43405 635 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SURF1Q15526 300 aa24.85■■□□□ 1.57
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PTPN4-208ENST00000460289 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 DSEQ9UL01 958 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SPTLC1O15269 473 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PNPLA4P41247 253 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PSMD2Q13200 908 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 NXPE3Q969Y0 559 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 MYADMQ96S97 322 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 KCNK12Q9HB15 430 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TRIOO75962 3097 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TGFB1I1O43294 461 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 CYP11A1P05108 521 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ADCY1Q08828 1119 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 TDGQ13569 410 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 MYBPC2Q14324 1141 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 SV2CQ496J9 727 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 METTL23Q86XA0 190 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF560Q96MR9 790 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPN4-208ENST00000460289 MYO10Q9HD67 2058 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 KPNA7A9QM74 516 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 CYB561D2O14569 222 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 KLRC4O43908 158 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 SEC24AO95486 1093 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 LAMP2P13473 410 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 ANK1P16157 1881 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPN4-208ENST00000460289 PTPN2P17706 415 aa24.82■■□□□ 1.56
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