RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 OR4Q2P0C623 313 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 SPATA20Q8TB22 786 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 DMAC2Q9NW81 257 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 SIX4Q9UIU6 781 aa22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 ANK1P16157 1881 aa22.14■■□□□ 1.14
PTX4-203ENST00000447419 VWA8A3KMH1 1905 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 M0QZQ0 153 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SYN3O14994 580 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 KIF20AO95235 890 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 NR2F2P24468 414 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TAF6P49848 677 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 DLG4P78352 724 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CREMQ03060 361 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 BFSP1Q12934 665 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PSMD6Q15008 389 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ZNF516Q92618 1163 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.14■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CYB561D2O14569 222 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TNNC2P02585 160 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PDXDC1Q6P996 788 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 LILRA6Q6PI73 481 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 USP37Q86T82 979 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 APPL2Q8NEU8 664 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CXorf38Q8TB03 319 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CGRRF1Q99675 332 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.13■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 BMP6P22004 513 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ROR1Q01973 937 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ZNF280DQ6N043 979 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 WDR49Q8IV35 697 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TMEM209Q96SK2 561 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CD320Q9NPF0 282 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.12■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 WDR27A2RRH5 827 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 KPNA7A9QM74 516 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 DLL1O00548 723 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 AKAP3O75969 853 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ODC1P11926 461 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SURF1Q15526 300 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 WSCD1Q658N2 575 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CES5AQ6NT32 575 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 GPR65Q8IYL9 337 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 BORCS6Q96GS4 357 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PLXNA3P51805 1871 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 H7C4K7 107 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CLSTN1O94985 981 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CPB1P15086 417 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 RBP5P82980 135 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ADAM9Q13443 819 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 RAB33AQ14088 237 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SV2CQ496J9 727 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ZNF560Q96MR9 790 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 GBP4Q96PP9 640 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 POMKQ9H5K3 350 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 FAM50BQ9Y247 325 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 MUC3AQ02505 3323 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 TBC1D4O60343 1298 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 C8AP07357 584 aa22.1■■□□□ 1.13
PTX4-203ENST00000447419 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.1■■□□□ 1.13
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