RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPFIA2O75334 1257 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 IVLP07476 585 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYZAPP0CAP1 466 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNJ1P48048 391 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRAK1P51617 712 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGAP1Q07960 439 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTP4A2Q12974 167 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZDHHC24Q6UX98 284 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 FBXO25Q8TCJ0 367 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 CISHQ9NSE2 258 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.89■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL21P46778 160 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 FNTAP49354 379 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP1A2P50993 1020 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF394Q53GI3 561 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TXLNGYQ9BZA5 131 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC19Q9H756 370 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCINQ9Y6U3 715 aa26.89■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASAP2O43150 1006 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 C22orf31O95567 290 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNGT1P63211 74 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 IQCF3P0C7M6 154 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 INSRRP14616 1297 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SGO2Q562F6 1265 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.88■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GJB6O95452 261 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TNNC2P02585 160 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 WEE2P0C1S8 567 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 NR1D1P20393 614 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 LAMC2Q13753 1193 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF699Q32M78 642 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAPT1Q6NXT6 567 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDT1Q9H211 546 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARVAQ9NVD7 372 aa26.87■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 LGALS2P05162 132 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADORA2AP29274 412 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GBP1P32455 592 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNA1P78396 465 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM192Q8IY95 271 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PASKQ96RG2 1323 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 O00370 1275 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 B4GALT4O60513 344 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ECEL1O95672 775 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 MMP8P22894 467 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARP2Q9UGN5 583 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 USTQ9Y2C2 406 aa26.86■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CXCL8P10145 99 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAS2R40P59535 323 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX1Q13596 522 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPDYCQ5MJ68 293 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 RHOT1Q8IXI2 618 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R16BQ96T49 567 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 HERPUD2Q9BSE4 406 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRIN2DO15399 1336 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDHXO00330 501 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASPAP45381 313 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PMS2P54278 862 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP1R7Q15435 360 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAIP1Q8WWC4 291 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 EVPLQ92817 2033 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSTPIP1O43586 416 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 GH1P01241 217 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHKA2P46019 1235 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDCLQ13371 301 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHST7Q9NS84 486 aa26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A087WZ62 844 aa26.83■■□□□ 1.89
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