RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-211ENST00000429595 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRK-211ENST00000429595 TLR9Q9NR96 1032 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-211ENST00000429595 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRK-211ENST00000429595 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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PTPRK-211ENST00000429595 AKR1A1P14550 325 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRK-211ENST00000429595 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRK-211ENST00000429595 AVPR2P30518 371 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-211ENST00000429595 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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