RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 RHOBTB3O94955 611 aa27.03■■□□□ 1.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC7Q8WUI4 952 aa27.03■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SENP8Q96LD8 212 aa27.03■■□□□ 1.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 USP37Q86T82 979 aa27.02■■□□□ 1.92
HTATSF1-202ENST00000425695 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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HTATSF1-202ENST00000425695 OR5B17Q8NGF7 314 aa27■■□□□ 1.91
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HTATSF1-202ENST00000425695 POLIQ9UNA4 740 aa26.96■■□□□ 1.91
HTATSF1-202ENST00000425695 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.96■■□□□ 1.91
HTATSF1-202ENST00000425695 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.95■■□□□ 1.91
HTATSF1-202ENST00000425695 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.95■■□□□ 1.9
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