RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 MYL2P10916 166 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ITGA4P13612 1032 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RASA1P20936 1047 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ACOT2P49753 483 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RAET1EQ8TD07 263 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 GPRASP2Q96D09 838 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 HBP1O60381 514 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PRR5LQ6MZQ0 368 aa13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MTF1Q14872 753 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ARL8AQ96BM9 186 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RUBCNLQ9H714 662 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CHN1P15882 459 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 KCNK16Q96T55 309 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 WASHC5Q12768 1159 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SLC30A5Q8TAD4 765 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 DACH2Q96NX9 599 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ERAP1Q9NZ08 941 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SUFUQ9UMX1 484 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CDYLQ9Y232 598 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 NDUFS3O75489 264 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 HLA-DRAP01903 254 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 APOA4P06727 396 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 POLBP06746 335 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CYP2C8P10632 490 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 FBXO33Q7Z6M2 555 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 VPS33BQ9H267 617 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.73□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ZBTB7AO95365 584 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 APRTP07741 180 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 KLC4Q9NSK0 619 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 FHOD1Q9Y613 1164 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PTK6Q13882 451 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RMDN2Q96LZ7 410 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RALBP11234 206 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ICE2Q659A1 982 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SELENONQ9NZV5 590 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 HACL1Q9UJ83 578 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 USP32Q8NFA0 1604 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ZNF185O15231 689 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ARHGEF9O43307 516 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 GUCY1A3Q02108 690 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PTK7Q13308 1070 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 LINC00523Q86TU6 105 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CHP1Q99653 195 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 C5orf58C9J3I9 102 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 PDHA1P08559 390 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 CPT1AP50416 773 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 JAMLQ86YT9 394 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MS4A14Q96JA4 679 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 ISCUQ9H1K1 167 aa13.72□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 STK25O00506 426 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.219e-7■■■□□ 18.7
TNS1-205ENST00000419504 PSTPIP1O43586 416 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RPS6KA5O75582 802 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 NTSR2O95665 410 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 RGS4P49798 205 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.71□□□□□ -0.21
TNS1-205ENST00000419504 MMGT1Q8N4V1 131 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms