RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 A0A088AWK7 358 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CAPN8A6NHC0 703 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 LPXNO60711 386 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NDUFA10O95299 355 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 BMPR1AP36894 532 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SREBF1P36956 1147 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CACNB3P54284 484 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NOGQ13253 232 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CSRP2Q16527 193 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 DAAM2Q86T65 1068 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SMC5Q8IY18 1101 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 LCORLQ8N3X6 602 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 C3orf20Q8ND61 904 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 REPS2Q8NFH8 660 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 RAB24Q969Q5 203 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 LANCL2Q9NS86 450 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 TDP1Q9NUW8 608 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 POLHQ9Y253 713 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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PTPRC-207ENST00000418674 LRRC14BA6NHZ5 514 aa3.62□□□□□ -1.83
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF185O15231 689 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 AMY1AP04745 511 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 IL2RBP14784 551 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 BMP5P22003 454 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 GUCY1A2P33402 732 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 HTR3AP46098 478 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 AVPR1BP47901 424 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CHN2P52757 468 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 RAP2BP61225 183 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 RAB1AP62820 205 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 GPSM2P81274 684 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ATP8B2P98198 1209 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 GUCY1B3Q02153 619 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 COL10A1Q03692 680 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SP140Q13342 867 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 MORC3Q14149 939 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 RAB39AQ14964 217 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 GORABQ5T7V8 394 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 RNF220Q5VTB9 566 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 KRT78Q8N1N4 520 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 IFI44Q8TCB0 444 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 GJA10Q969M2 543 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 TEX101Q9BY14 249 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 TOR3AQ9H497 397 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.62□□□□□ -1.83
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