RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SPOPLQ6IQ16 392 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF365Q70YC5 407 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf56Q9H5V9 222 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 USTQ9Y2C2 406 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 EZRP15311 586 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SFNP31947 248 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A1P43005 524 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ2P63252 427 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT76Q01546 638 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTN2Q02246 1040 aa19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEC3Q8TD91 643 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CKAP2Q8WWK9 683 aa19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM81BQ96LP2 452 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ECT2Q9H8V3 914 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PXMP2Q9NR77 195 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CSADQ9Y600 493 aa19.83■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 STX2P32856 288 aa19.82■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF862O60290 1169 aa19.82■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 IZUMO3Q5VZ72 239 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 EEPD1Q7L9B9 569 aa19.82■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 OSBPL8Q9BZF1 889 aa19.81■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 FNBP1Q96RU3 617 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA3Q9UL41 463 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 NEU2Q9Y3R4 380 aa19.81■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF2BQ8N4N8 673 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC89Q8N998 374 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM22Q9P0K1 906 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 NQO1P15559 274 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 CCNG2Q16589 344 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 GARTP22102 1010 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 P3H1Q32P28 736 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNTL6Q49A17 601 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR78Q5VTH9 848 aa19.79■□□□□ 0.76
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SH3BP1-202ENST00000417536 KAZNQ674X7 775 aa19.79■□□□□ 0.76
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