RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 GNASQ5JWF2 1037 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF135Q8IUD6 432 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF197O14709 1029 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 KLK7P49862 253 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C4orf22Q6V702 233 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ITSN1Q15811 1721 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP2C8P10632 490 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ERO1BQ86YB8 467 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 USP38Q8NB14 1042 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LCA5Q86VQ0 697 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AGAP3Q96P47 875 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CARD9Q9H257 536 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP73A6NFT4 308 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TAF6P49848 677 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RNF217Q8TC41 542 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DYRK4Q9NR20 520 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 13.3
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SH3BP4-203ENST00000409212 PEX19P40855 299 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 HADHAP40939 763 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TBCCQ15814 346 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CD302Q8IX05 232 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 C9orf72Q96LT7 481 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CHUKO15111 745 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MTSS1O43312 755 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 E2F6O75461 281 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO1DO94832 1006 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF2A2P52657 109 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FIGNQ5HY92 759 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 H0Y3Z8 333 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RBP3P10745 1247 aa16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP4-203ENST00000409212 CUL2Q13617 745 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TRADDQ15628 312 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 BOLA3Q53S33 107 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA18Q8TC71 538 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SGSM3Q96HU1 749 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ERP44Q9BS26 406 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CST8O60676 142 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ALDH1A1P00352 501 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 Q4G0T1 1027 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 MROH8Q9H579 483 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NPTXRO95502 500 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GARTP22102 1010 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 RAD51CO43502 376 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 GRAP2O75791 330 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXL16Q8N461 479 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NAGPAQ9UK23 515 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJC6O75061 913 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 TGFB2P61812 414 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SREBF2Q12772 1141 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 NTRK3Q16288 839 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA21Q7Z572 469 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-203ENST00000409212 ARP10275 920 aa16.66■□□□□ 0.26
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