RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.84■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.84■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 SCN1AP35498 2009 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 KINO60870 393 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 NR3C1P04150 777 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 ITGB3P05106 788 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 PRCPP42785 496 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 NFIL3Q16649 462 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF516Q92618 1163 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 SMARCE1Q969G3 411 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 SENP8Q96LD8 212 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 CD320Q9NPF0 282 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.83■□□□□ 0.93
MESTP1-201ENST00000404287 EXOC3O60645 756 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 OAZ2O95190 189 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 OR1D2P34982 312 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 MYBPC2Q14324 1141 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 WDR49Q8IV35 697 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CGRRF1Q99675 332 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 RMND1Q9NWS8 449 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TSC2P49815 1807 aa20.82■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 RFPL2O75678 378 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 SMC2O95347 1197 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CYP11A1P05108 521 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 WEE2P0C1S8 567 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TYMPP19971 482 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CLDN10P78369 228 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ROR1Q01973 937 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ZP2Q05996 745 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 SURF1Q15526 300 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ADSSL1Q8N142 457 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.81■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 WDR27A2RRH5 827 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ABLIM3O94929 683 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 KIF20AO95235 890 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 PAX3P23760 479 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TAF6P49848 677 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ITIH3Q06033 890 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CENPPQ6IPU0 288 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 APPL2Q8NEU8 664 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.8■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 KPNA7A9QM74 516 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 AKAP3O75969 853 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 VNN2O95498 520 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 DLG4P78352 724 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 MORC3Q14149 939 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ISM2Q6H9L7 571 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 GPR149Q86SP6 731 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 H7C4K7 107 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 NR2F2P24468 414 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF280DQ6N043 979 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.78■□□□□ 0.92
MESTP1-201ENST00000404287 POMKQ9H5K3 350 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms