RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399687.3

ABCD1P4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene ABCD1P4, Length 604 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P4-201ENST00000399687 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 SPATA18Q8TC71 538 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 MTRRQ9UBK8 725 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 VWA8A3KMH1 1905 aa14.78□□□□□ -0.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 HUS1O60921 280 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 AKAP3O75969 853 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 KCNA5P22460 613 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATICP31939 592 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 GTF2H1P32780 548 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 BRCC3P46736 316 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 GUCY2FP51841 1108 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLDN10P78369 228 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CETN1Q12798 172 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 GPT2Q8TD30 523 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 HPDLQ96IR7 371 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.77□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 OR6C75A6NL08 312 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PER2O15055 1255 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TEX28O15482 410 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TNNC1P63316 161 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ADAM15Q13444 863 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CES5AQ6NT32 575 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 RTL10Q7L3V2 364 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TAF4BQ92750 862 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 SENP8Q96LD8 212 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAFFQ9ULX9 164 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TSC2P49815 1807 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 SCN1AP35498 2009 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 I3L4J1 428 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CYB561D2O14569 222 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LILRB3O75022 631 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 OAZ2O95190 189 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC192P0DO97 292 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CPB1P15086 417 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PIK3CAP42336 1068 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CASP4P49662 377 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLCN4P51793 760 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 NLRP12P59046 1061 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYL7Q01449 175 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ITIH3Q06033 890 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TTI2Q6NXR4 508 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 DPH6Q7L8W6 267 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 B3GALT6Q96L58 329 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CD207Q9UJ71 328 aa14.75□□□□□ -0.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms