RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 GLUD1P00367 558 aa16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCNE1P24864 410 aa16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.6■□□□□ 0.25
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PGGT1B-202ENST00000379615 CD207Q9UJ71 328 aa16.59■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC28Q96AY4 2481 aa16.59■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 KPNA7A9QM74 516 aa16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PPEF2O14830 753 aa16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLCN4P51793 760 aa16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.58■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.58■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYB561D2O14569 222 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 STX10O60499 249 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX10O75333 385 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP3O75969 853 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 GLP2RO95838 553 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR1D2P34982 312 aa16.57■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 RAB33AQ14088 237 aa16.57■□□□□ 0.24
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PGGT1B-202ENST00000379615 HPDLQ96IR7 371 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP63Q96MT8 703 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC1BQ9P126 229 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 DACH1Q9UI36 760 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SCN1AP35498 2009 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRJQ12913 1337 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6C75A6NL08 312 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTLC1O15269 473 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 HUS1O60921 280 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP11A1P05108 521 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 EPCAMP16422 314 aa16.56■□□□□ 0.24
PGGT1B-202ENST00000379615 PTMSP20962 102 aa16.56■□□□□ 0.24
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