RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.27■■□□□ 1.64
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C9orf47-202ENST00000375850 CXCL8P10145 99 aa25.26■■□□□ 1.63
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C9orf47-202ENST00000375850 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf47-202ENST00000375850 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
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C9orf47-202ENST00000375850 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.24■■□□□ 1.63
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C9orf47-202ENST00000375850 ZNF263O14978 683 aa25.23■■□□□ 1.63
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C9orf47-202ENST00000375850 VITQ6UXI7 678 aa25.23■■□□□ 1.63
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C9orf47-202ENST00000375850 SPATA1Q5VX52 437 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.2■■□□□ 1.62
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C9orf47-202ENST00000375850 PATJQ8NI35 1801 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 FAM189A1O60320 539 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 TNFSF9P41273 254 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 MCM2P49736 904 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 SPAG1Q07617 926 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 TEAD2Q15562 447 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
C9orf47-202ENST00000375850 C8orf34Q49A92 452 aa25.19■■□□□ 1.62
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