RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 DYRK1AQ13627 763 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CEP78Q5JTW2 689 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 FATE1Q969F0 183 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ACAP3Q96P50 834 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PPP6CO00743 305 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 GPR32O75388 356 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 MUM1Q2TAK8 710 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 MUM1L1Q5H9M0 696 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 NINJ1Q92982 152 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 KLC4Q9NSK0 619 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 TISP43B9A030 160 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 SUN1O94901 812 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ATP8B2P98198 1209 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PBKQ96KB5 322 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 ENDOD1O94919 500 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 CYP2D6P10635 497 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CCKARP32238 428 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 MCAMP43121 646 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CCT8P50990 548 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 TCEA2Q15560 299 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 AHI1Q8N157 1196 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 RFKQ969G6 155 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 REPS1Q96D71 796 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-202ENST00000367364 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF134P52741 427 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 ITIH3Q06033 890 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 KRT73Q86Y46 540 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 RHOP08100 348 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00205P59089 165 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 MIDNQ504T8 468 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 CMIPQ8IY22 773 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 EBF3Q9H4W6 596 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 TUBB4AP04350 444 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 PCSK6P29122 969 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 MGAT2Q10469 447 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 ANO4Q32M45 955 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 BPIP17213 487 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 MALLQ13021 153 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-202ENST00000367364 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-202ENST00000367364 ORAI2Q96SN7 254 aa5.61□□□□□ -1.51
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