RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CAVIN3Q969G5 261 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 VOPP1Q96AW1 172 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MVB12AQ96EY5 273 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 COQ10AQ96MF6 247 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.7□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM227AF5H4B4 570 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 PRC1O43663 620 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CDKL5O76039 1030 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 GNAI3P08754 354 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 POU2F2P09086 479 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 HKR1P10072 659 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGAMP11215 1152 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 DDCP20711 480 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FGFR4P22455 802 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MPLP40238 635 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 GNAI1P63096 354 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MXRA7P84157 204 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC142Q17RM4 750 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 DAAM2Q86T65 1068 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 C3orf20Q8ND61 904 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 DPF2Q92785 391 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 HPS3Q969F9 1004 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC17Q96AE7 1141 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 NACC2Q96BF6 587 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 USP25Q9UHP3 1055 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1B0GTW7 788 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 VSTM5A8MXK1 200 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BML4 177 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CAND2O75155 1236 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 HLA-DOAP06340 250 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 AVPR1BP47901 424 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC41Q15345 812 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 PRR16Q569H4 304 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF529Q6P280 563 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 KAT5Q92993 513 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF31Q96EP0 1072 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 Q96MF0 132 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 WDCPQ9H6R7 721 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF181Q9P0P0 153 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 IPPQ9Y573 584 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.68□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MASP2O00187 686 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 MGST3O14880 152 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ZFPL1O95159 310 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ESRRBO95718 433 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 FOSP01100 380 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 POMCP01189 267 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 AMY1AP04745 511 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CD1AP06126 327 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 GCSHP23434 173 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CXCR5P32302 372 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CACNB3P54284 484 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CTXN1P60606 82 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 CXADRP78310 365 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 HSD11B2P80365 405 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 IL10RAQ13651 578 aa3.67□□□□□ -1.82
SNORD3E-201ENST00000362899 COLEC12Q5KU26 742 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms